Universitas Islam Al-Kifayah Riau, yang berada di bawah naungan Yayasan Kifayatul Akhyar, dipimpin oleh Rektor Assoc. Prof. Dr. Zalisman, S.Pd., M.Pd.I dalam menjalankan visi universitas sebagai perguruan tinggi Islam yang unggul dan berdaya saing. Dalam melaksanakan tata kelola perguruan tinggi, Rektor didukung oleh Wakil Rektor I Syahri Ramadhan, S.Psi., M.S.I, Wakil Rektor II Lita Arfah, S.P., M.Si, dan Wakil Rektor III Sahrin, S.H., M.H, yang membidangi akademik, administrasi dan keuangan, serta kemahasiswaan dan kerja sama.

Struktur organisasi universitas juga didukung oleh Senat Universitas yang diketuai oleh Assoc. Prof. Dr. Parlindungan S., M.Us, serta berbagai unit pelaksana akademik dan administrasi. Dalam bidang penelitian dan pengabdian kepada masyarakat, universitas memiliki Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat (LPPM) yang dipimpin oleh Nelia Guswanti, S.Pd., M.Pd, serta Lembaga Penjaminan Mutu (LPM) yang dipimpin oleh Marroaini, M.E untuk memastikan mutu pendidikan dan tata kelola universitas berjalan sesuai standar yang ditetapkan.

Penyelenggaraan pendidikan dilaksanakan melalui tiga fakultas, yaitu Fakultas Tarbiyah dan Keguruan, Fakultas Syariah dan Hukum, serta Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam, yang masing-masing dipimpin oleh dekan dan didukung oleh ketua program studi. Program studi yang dikelola meliputi PGMI, PIAUD, PAI, BKPI, HTN, HKI, AKS, MBS, serta Program Magister PAI dan Program Magister HKI.

Dalam mendukung layanan akademik dan administrasi, Universitas Islam Al-Kifayah Riau memiliki berbagai unit dan bagian strategis, di antaranya Biro Administrasi Akademik dan Kemahasiswaan (BAAK), Biro Administrasi Umum (BAU), Perpustakaan, Bagian Teknologi Informasi, Laboratorium, Keuangan, Sarana dan Prasarana, serta unit pelayanan lainnya yang berperan dalam menunjang pelaksanaan Tri Dharma Perguruan Tinggi.

Dengan dukungan sumber daya manusia yang profesional, tata kelola yang terintegrasi, serta komitmen terhadap peningkatan mutu pendidikan, Universitas Islam Al-Kifayah Riau terus berupaya mewujudkan visinya sebagai perguruan tinggi Islam yang unggul dengan semangat “Mengukir Khidmat, Membina Masa Depan”, serta memberikan kontribusi nyata bagi pembangunan masyarakat, bangsa, dan peradaban.